อำนาจหน้าที่ของสำนักงานอัยการเขต 9 เป็นส่วนราชกในสำนักงานอัยกาสุงสุด รับผิดชอบบริหารกำกับกูแล สำนักงานอัยการที่ตั้งอยุ่ในพื้นที่จังหวัดภาคใต้ 7 จังหวัด คือ สงขลา สตุล พัืทลุง ตรัง ปัตตานี ยะลา นราธิวาส มีอำนาจหน้าที่ตามกฎกระทรวงแบ่งส่วนราชการสำนักงานอัยการสูงสุด พ.ศ. 2549 ดังนี้ 1. รับผิดชอบการบริหารงานและปฏิบัติงานในอำนาจหน้าที่ของสำนักงานอัยการสูงสุดภายในเขตท้องที่ ทั้งนี้ตามกฎหมาย ระเบียบ ข้อบังคับ และคำสั่งของสำนักงานอัยการสูงสุด 2.รับผิดชอบงานคุ้มครองสิทธิและช่วยเหลือทางกฎหมายแก่ประชาชนภายในเขตท้องที่ของสำนักงานอัยการเขต ตามที่สำนักงานอัยการสูงสุดกำหนด 3. ปฏิบัติงานิร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือที่ได้รับมอบหมาย
มีส่วนราชการในสำนักงานอัยการเขต 9 ดังนี้ ฝ่ายกิจการทั่วไปสำนักงานอัยการเขต มีอำนาจหน้าที่ดังนี้ 1. รับผิดชอบงานธุรการ สารบบคดี งานบริหารงานบุคคล งานเลขานุการนักบริหาร งานงบปะมาณ งานการเงินและบัญชี แลุะงานเกี่ยวกับอาคารสถานที่ พัสดุ และยานพาหนะของสำนักงานอัยการเขต 2. ปฏิบัติงานร่วมกับหรือการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือได้รับมอบหมาย สำนักงานอัยการพิเศษฝ่ายคดีอาญา มีอำนาจหน้าที่ดังนี้ 1.รับผิดชอบงานดำเนินคดีอาญาของสำนักงานอัยการเขตซึ่งไม่อยู่ในอำนาจหน้าที่ของสำนักงานคดีศาลสูงเขต และงานบริหารการจัดการของสำนักงานอัยการเขต 2. ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือได้รับมอบหมาย สำนักงานอัยการพิเศษฝ่ายคุ้มครองสิทธิและช่วยเหลือทางกฎหมายเขต มีอำนาจหน้าที่ดังนี้ 1. รับผิดชอบงานคุ้มครองสิทธิและช่วยเหลือทางกฎหมายแก่ประชาชนภายในเขตท้องที่ของสำนักงานอัยการ เขตตามที่สำนักงานอัยการสูงสุดกำหนด 2. ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือที่ได้รับมอบหมาย